El agua en esos sitios suele estar embebida en los poros rocosos, y/o en estado sólido.
Por otro lado, el agua no "absorbe radiación". Otros materiales pueden tener capturas y producir algún isótopo inestable, pero en el agua el proceso más probable es la captura de neutrones para convertir los átomos de hidrógeno en deuterio o tritio, que son muy levemente radioactivos (beta). El efecto más importante probablemente es que se ioniza, pero eso no es un problema a minutos vista.
No creo que tal cosa sea un problema.
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